MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187131	GAA	2	6	30	35	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187131	GAA	2	6	74	79	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248356
3	NT_187131	CCG	2	6	112	117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248356
4	NT_187131	TAT	2	6	119	124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248356
5	NT_187131	ACG	2	6	139	144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248356
6	NT_187131	CGA	2	6	146	151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248356
7	NT_187131	GTG	2	6	216	221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248356
8	NT_187131	AGA	2	6	230	235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248356
9	NT_187131	CCGT	2	8	238	245	0 %	25 %	25 %	50 %	409248356
10	NT_187131	GTC	2	6	303	308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248356
11	NT_187131	TC	3	6	307	312	0 %	50 %	0 %	50 %	409248356
12	NT_187131	ATC	2	6	315	320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248356
13	NT_187131	ATG	2	6	495	500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248356
14	NT_187131	GT	3	6	532	537	0 %	50 %	50 %	0 %	409248356
15	NT_187131	TTATCC	2	12	574	585	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	409248356
16	NT_187131	CGG	2	6	589	594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248356
17	NT_187131	GTG	2	6	606	611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248356
18	NT_187131	GAA	2	6	645	650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248356
19	NT_187131	GAC	2	6	717	722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248356
20	NT_187131	TTA	2	6	749	754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187131	TTA	2	6	846	851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187131	CAA	2	6	904	909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NT_187131	GA	3	6	1021	1026	50 %	0 %	50 %	0 %	409248357
24	NT_187131	GCA	2	6	1042	1047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248357
25	NT_187131	TG	3	6	1060	1065	0 %	50 %	50 %	0 %	409248357
26	NT_187131	TGT	2	6	1098	1103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248357
27	NT_187131	CCG	2	6	1134	1139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248357
28	NT_187131	GT	3	6	1147	1152	0 %	50 %	50 %	0 %	409248357
29	NT_187131	AGT	2	6	1181	1186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248357
30	NT_187131	GTAA	2	8	1379	1386	50 %	25 %	25 %	0 %	409248357
31	NT_187131	AAG	2	6	1439	1444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187131	GGA	2	6	1481	1486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187131	TATT	2	8	1487	1494	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187131	TTTA	2	8	1500	1507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187131	TTCGAT	2	12	1597	1608	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	409248358
36	NT_187131	GAA	2	6	1848	1853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248358
37	NT_187131	CGA	2	6	1872	1877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248358
38	NT_187131	ATC	2	6	1891	1896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248358
39	NT_187131	CCA	2	6	1976	1981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248358
40	NT_187131	GCA	2	6	2025	2030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248358
41	NT_187131	CTGG	2	8	2061	2068	0 %	25 %	50 %	25 %	409248358
42	NT_187131	GGA	2	6	2091	2096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248358
43	NT_187131	A	6	6	2152	2157	100 %	0 %	0 %	0 %	409248358
44	NT_187131	CAGA	2	8	2311	2318	50 %	0 %	25 %	25 %	409248358
45	NT_187131	TG	4	8	2327	2334	0 %	50 %	50 %	0 %	409248358
46	NT_187131	CAG	2	6	2476	2481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248358
47	NT_187131	GGT	2	6	2487	2492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248358
48	NT_187131	AATCG	2	10	2583	2592	40 %	20 %	20 %	20 %	409248358
49	NT_187131	GCT	2	6	2661	2666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248358
50	NT_187131	TGA	2	6	2678	2683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248358
51	NT_187131	ATTT	2	8	2746	2753	25 %	75 %	0 %	0 %	409248358
52	NT_187131	AAT	2	6	2767	2772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248358
53	NT_187131	TGA	2	6	2774	2779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248358
54	NT_187131	CT	3	6	2818	2823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NT_187131	ATTT	2	8	2824	2831	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187131	AGCGTT	2	12	2962	2973	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NT_187131	TGA	2	6	3111	3116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187131	AT	3	6	3127	3132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187131	CGG	2	6	3150	3155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NT_187131	GTC	2	6	3169	3174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NT_187131	TGA	2	6	3184	3189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187131	TGG	2	6	3195	3200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187131	GCG	2	6	3239	3244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.